Jean-Aimé Mougenot se incorporó a la SNCF en 1980 como maquinista en la región de Midi-Pyrénées, donde adquirió una sólida experiencia en el sector ferroviario y un profundo conocimiento de la zona.
Director de los establecimientos Oise y Paris Nord de SNCF Traction de 1994 a 2002, fue nombrado a continuación responsable de la organización del trabajo de los maquinistas, antes de convertirse en Director de Recursos Humanos de la actividad de conducción de SNCF en 2004.
Continuó su carrera en TER, donde, de 2011 a 2013, fue Director Regional de SNCF TER Picardie. De 2014 a 2016, fue Director Adjunto de TER Francia.
En 2016, fue nombrado Director de la región TER Sud-Provence-Alpes-Côte d'Azur para SNCF Voyageurs. En este puesto, garantizó la firma de un nuevo acuerdo de explotación en enero de 2019 y preparó la respuesta a las primeras licitaciones lanzadas por la Región Sur para sacar a concurso la explotación de la red regional. En 2017, también puso en marcha un plan de transformación, que ha dado resultados visibles en términos de calidad del servicio.
Desde 2021, es Director Adjunto TER de SNCF Voyageurs. En particular, se encarga de renovar los convenios de explotación con las 11 Autoridades Organizadoras antes de la fecha límite de finales de 2023 fijada por la ley, así como de crear las primeras empresas dedicadas a la explotación de los lotes ganados por SNCF Voyageurs en las licitaciones lanzadas por las Regiones.
